中国科学院自动化研究所成立于1956年10月，是我国最早成立的国立自动化研究机构。1968年，为加速我国空间技术的发展，自动化所整建制划入空间技术研究院，更名为空间控制技术研究所，番号中国人民解放军第五○二研究所。1970年，根据自动化学科技术发展的需要，中国科学院重建自动化研究所。 　　六十多年来，自动化所为我国国民经济建设、社会进步、科技发展和国家安全做出了重要的贡献。建国发展初期，自动化所开拓了我国的控制科学，为“两弹一星”做出了历史性的贡献；改革开放年代，自动化所开创了我国模式识别智能信息处理的新领域，并在科技成果转化方面进行了积极的尝试，创立了享誉中关村的中自集团。2011年底，自动化所进入中国科学院“创新2020工程”。全所围绕科技创新、科技成果产业化、队伍建设和人才培养、体制机制改革和创新文化建设等，开展了卓有成效的创新试点，取得了显著的成效，为研究所的创新跨越、持续发展奠定了坚实的基础。 　　自动化所现设科研开发部门12个，包括模式识别国家重点实验室、复杂系统管理与控制国家重点实验室、国家专用集成电路设计工程技术研究中心、中国科学院分子影像重点实验室、高技术创新中心、综合信息系统研究中心、数字内容技术与服务研究中心、精密感知与控制研究中心、空天信息研究中心、脑网络组研究中心、智能感知与计算研究中心、类脑智能研究中心。还有若干与国际和社会其他创新单元共建的各类联合实验室和工程中心。另有汉王科技、三博中自等四十余家持股高科技公司。 　　截至2017年底，自动化所共有在职职工896人，其中科技人员795人，科技支撑人员54人。包括中国科学院院士2人、发展中国家科学院院士1人、研究员及正高级工程技术人员92人，副研究员及高级工程技术人员229人。共有国家973项目首席科学家4人，IEEE Fellow 8人；中国科学院“百人计划”入选者22人，“西部之光”人才入选者2人；国家杰出青年科学基金获得者14人，国家优秀青年基金获得者5人，新世纪百千万人才工程入选者9人。 　　自动化所是1981年国务院学位委员会批准的首批博士、硕士学位授予权单位之一，现有控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、计算机应用技术和社会计算4个专业二级学科博士、硕士研究生培养点，并设有控制科学与工程1个专业一级学科博士后流动站。